He diseñado y colgado una página web formada por varios marcos. Cuando pongo la palabra clave que deseo buscar en el google, aparece mi página en el buscador pero no el index sino que aparece la correspondiente a uno de los marcos puesto que esa palabra clave está en ese marco. ¿¿Qué puedo hacer para que aparezca el index completo formado por tres marcos y no uno de los marcos sueltos??

es el "bendito" problema de los frames (marcos) . Solución no usarlos , diseña a página completa o infórmate de las ventajas de los includes de php con lo que logras lo mismo que con frames y sin los problemas de los mismos.