Hola mi web es http://magicpro.webcindario.com y he estado subiendo la web mediante el SmartFPT. Sin embargo ahora quiro hacerlo mediante la opcion de "Actualizar" del Frontapge, programa que utilizo para la creación de la web, pues es mucho más comodo que andar mirando que ha cambiado y resubirlo. Sin embargo, no me reconoce o no me deja conectar con el ftp. Cual es la ruta que tengo que teclear??

Seguramente te refieres a "Publicar" y no a actualizar, pero de todos modos la ruta que tienes que teclear sería la siguiente:
ftp://magicpro.webcindario.com y el usuario sería magicpro, y la contraseña, pues la de tu nick.