He estado subiendo archivos con WebFtp pero al querer meter muchos archivos resulta muy lento ir introduciendolos uno a uno.

He visto que hay un sistema de FTP pero no consigo utilizarlo. Si entro con Internet Explorer no llega nunca a ver los archivos aunque meta la clave.
Si lo abro con Netscape puedo ver los archivos pero no sé como introducir unos nuevos.
¿Alguien puede ayudarme?

Usa un programa tipo Cute Ftp o Smart Ftp, hay muchos por ahi...

Prueba el FlashFXP (y de desactiva el modo pasivo de tu cliente ftp) y vete de miarroba la ftp es un kaka n tira xD

Saludos ya keda menos