En el panel de control me sale un mensaje de error en la pàgina de inicio, diciendo que el index no es correcto. Tampoco puedo hacer nada ya que no cuando quiero entrar en el webftp me dice encuentra mis ficheros. A pesar de ello la página se habré aunque a veces con errores.
http://juanra.webcindario.com

Supongo que te referiras a que el webftp a veces no funciona, parece que esta fallando. Prueba mejor el ftp, de todas formas.

Sobre lo de la página de inicio se debe llamar index.html (o index.php si usas php). En tu caso la llamas index.htm y aunque también funciona sale el cartel.